Protein–RNA interactions for Protein: P51682

Ccr5, C-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccr5P51682 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ccr5P51682 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms