Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gpc4P51655 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gpc4P51655 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms