Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa8P50706 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Defa8P50706 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa8P50706 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa8P50706 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa8P50706 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa8P50706 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Defa8P50706 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms