Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp9P49962 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp9P49962 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp9P49962 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp9P49962 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp9P49962 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp9P49962 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Srp9P49962 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms