Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnni3P48787 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms