Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gli1P47806 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gli1P47806 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gli1P47806 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gli1P47806 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gli1P47806 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gli1P47806 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gli1P47806 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gli1P47806 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli1P47806 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli1P47806 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli1P47806 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gli1P47806 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms