Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax9P47242 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax9P47242 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pax9P47242 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax9P47242 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax9P47242 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Pax9P47242 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms