Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax7P47239 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax7P47239 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax7P47239 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax7P47239 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax7P47239 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax7P47239 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax7P47239 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Pax7P47239 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax7P47239 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax7P47239 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pax7P47239 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax7P47239 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pax7P47239 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax7P47239 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pax7P47239 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pax7P47239 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax7P47239 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax7P47239 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pax7P47239 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Pax7P47239 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax7P47239 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax7P47239 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax7P47239 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax7P47239 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax7P47239 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax7P47239 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pax7P47239 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax7P47239 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax7P47239 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax7P47239 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax7P47239 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pax7P47239 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pax7P47239 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pax7P47239 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pax7P47239 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pax7P47239 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pax7P47239 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pax7P47239 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pax7P47239 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax7P47239 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pax7P47239 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pax7P47239 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Pax7P47239 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pax7P47239 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Pax7P47239 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax7P47239 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax7P47239 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pax7P47239 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pax7P47239 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pax7P47239 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pax7P47239 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax7P47239 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pax7P47239 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax7P47239 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pax7P47239 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pax7P47239 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pax7P47239 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax7P47239 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax7P47239 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax7P47239 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax7P47239 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pax7P47239 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pax7P47239 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax7P47239 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax7P47239 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax7P47239 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pax7P47239 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax7P47239 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax7P47239 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pax7P47239 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax7P47239 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax7P47239 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax7P47239 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax7P47239 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pax7P47239 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pax7P47239 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax7P47239 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax7P47239 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax7P47239 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax7P47239 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax7P47239 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax7P47239 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax7P47239 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax7P47239 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax7P47239 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pax7P47239 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax7P47239 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax7P47239 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pax7P47239 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax7P47239 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pax7P47239 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax7P47239 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pax7P47239 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax7P47239 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax7P47239 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax7P47239 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pax7P47239 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pax7P47239 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pax7P47239 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms