Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syt1P46096 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syt1P46096 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syt1P46096 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Syt1P46096 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syt1P46096 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syt1P46096 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syt1P46096 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syt1P46096 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Syt1P46096 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syt1P46096 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syt1P46096 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Syt1P46096 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms