Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sdc2P43407 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Sdc2P43407 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sdc2P43407 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sdc2P43407 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sdc2P43407 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sdc2P43407 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sdc2P43407 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sdc2P43407 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sdc2P43407 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sdc2P43407 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sdc2P43407 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sdc2P43407 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sdc2P43407 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdc2P43407 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdc2P43407 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdc2P43407 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdc2P43407 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdc2P43407 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdc2P43407 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdc2P43407 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdc2P43407 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdc2P43407 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdc2P43407 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdc2P43407 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdc2P43407 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdc2P43407 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sdc2P43407 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms