Protein–RNA interactions for Protein: P43241

Cdx2, Homeobox protein CDX-2, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx2P43241 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdx2P43241 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdx2P43241 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdx2P43241 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cdx2P43241 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdx2P43241 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Cdx2P43241 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cdx2P43241 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdx2P43241 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdx2P43241 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdx2P43241 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cdx2P43241 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cdx2P43241 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdx2P43241 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdx2P43241 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdx2P43241 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdx2P43241 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdx2P43241 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdx2P43241 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdx2P43241 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdx2P43241 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdx2P43241 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdx2P43241 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdx2P43241 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdx2P43241 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdx2P43241 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdx2P43241 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdx2P43241 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdx2P43241 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdx2P43241 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdx2P43241 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cdx2P43241 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdx2P43241 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx2P43241 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx2P43241 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx2P43241 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx2P43241 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx2P43241 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cdx2P43241 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx2P43241 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx2P43241 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cdx2P43241 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx2P43241 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx2P43241 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx2P43241 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx2P43241 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cdx2P43241 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx2P43241 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx2P43241 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx2P43241 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx2P43241 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx2P43241 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx2P43241 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx2P43241 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx2P43241 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx2P43241 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx2P43241 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdx2P43241 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdx2P43241 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdx2P43241 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdx2P43241 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdx2P43241 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdx2P43241 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdx2P43241 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdx2P43241 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdx2P43241 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdx2P43241 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdx2P43241 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdx2P43241 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdx2P43241 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdx2P43241 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdx2P43241 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdx2P43241 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdx2P43241 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdx2P43241 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdx2P43241 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdx2P43241 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cdx2P43241 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdx2P43241 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cdx2P43241 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdx2P43241 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdx2P43241 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdx2P43241 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdx2P43241 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cdx2P43241 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdx2P43241 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdx2P43241 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdx2P43241 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdx2P43241 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdx2P43241 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdx2P43241 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdx2P43241 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdx2P43241 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdx2P43241 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdx2P43241 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cdx2P43241 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdx2P43241 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cdx2P43241 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cdx2P43241 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cdx2P43241 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms