Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tnfsf9P41274 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms