Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csf3rP40223 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csf3rP40223 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms