Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Apoc3P33622 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Apoc3P33622 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Apoc3P33622 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Apoc3P33622 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoc3P33622 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms