Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BrafP28028 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BrafP28028 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BrafP28028 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BrafP28028 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BrafP28028 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BrafP28028 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BrafP28028 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BrafP28028 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BrafP28028 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BrafP28028 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BrafP28028 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
BrafP28028 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BrafP28028 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BrafP28028 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
BrafP28028 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BrafP28028 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BrafP28028 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BrafP28028 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BrafP28028 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BrafP28028 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BrafP28028 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BrafP28028 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BrafP28028 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BrafP28028 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
BrafP28028 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BrafP28028 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BrafP28028 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BrafP28028 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BrafP28028 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BrafP28028 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BrafP28028 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BrafP28028 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BrafP28028 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
BrafP28028 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
BrafP28028 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BrafP28028 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BrafP28028 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BrafP28028 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BrafP28028 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BrafP28028 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BrafP28028 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BrafP28028 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BrafP28028 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BrafP28028 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BrafP28028 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BrafP28028 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BrafP28028 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BrafP28028 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BrafP28028 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
BrafP28028 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BrafP28028 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BrafP28028 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BrafP28028 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BrafP28028 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BrafP28028 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BrafP28028 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BrafP28028 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BrafP28028 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BrafP28028 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BrafP28028 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BrafP28028 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BrafP28028 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BrafP28028 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BrafP28028 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BrafP28028 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BrafP28028 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BrafP28028 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BrafP28028 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BrafP28028 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BrafP28028 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BrafP28028 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BrafP28028 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BrafP28028 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BrafP28028 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BrafP28028 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BrafP28028 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BrafP28028 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
BrafP28028 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BrafP28028 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
BrafP28028 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BrafP28028 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BrafP28028 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BrafP28028 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BrafP28028 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BrafP28028 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BrafP28028 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BrafP28028 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BrafP28028 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BrafP28028 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BrafP28028 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BrafP28028 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BrafP28028 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BrafP28028 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BrafP28028 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BrafP28028 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
BrafP28028 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BrafP28028 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
BrafP28028 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
BrafP28028 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms