Protein–RNA interactions for Protein: P23979

Htr3a, 5-hydroxytryptamine receptor 3A, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr3aP23979 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Htr3aP23979 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htr3aP23979 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms