Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VimP20152 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VimP20152 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VimP20152 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VimP20152 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VimP20152 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VimP20152 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VimP20152 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VimP20152 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VimP20152 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VimP20152 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VimP20152 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VimP20152 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VimP20152 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VimP20152 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VimP20152 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VimP20152 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VimP20152 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VimP20152 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VimP20152 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VimP20152 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VimP20152 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VimP20152 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VimP20152 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VimP20152 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VimP20152 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VimP20152 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VimP20152 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VimP20152 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VimP20152 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VimP20152 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VimP20152 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VimP20152 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VimP20152 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VimP20152 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VimP20152 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VimP20152 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VimP20152 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VimP20152 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VimP20152 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VimP20152 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VimP20152 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VimP20152 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VimP20152 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VimP20152 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VimP20152 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VimP20152 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VimP20152 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
VimP20152 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VimP20152 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VimP20152 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VimP20152 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VimP20152 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VimP20152 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VimP20152 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VimP20152 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VimP20152 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VimP20152 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VimP20152 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VimP20152 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VimP20152 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VimP20152 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VimP20152 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VimP20152 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VimP20152 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VimP20152 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VimP20152 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VimP20152 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VimP20152 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VimP20152 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VimP20152 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VimP20152 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VimP20152 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VimP20152 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VimP20152 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VimP20152 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VimP20152 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VimP20152 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VimP20152 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
VimP20152 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VimP20152 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VimP20152 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VimP20152 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VimP20152 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VimP20152 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VimP20152 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VimP20152 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VimP20152 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VimP20152 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
VimP20152 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
VimP20152 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VimP20152 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VimP20152 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
VimP20152 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VimP20152 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VimP20152 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VimP20152 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VimP20152 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
VimP20152 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
VimP20152 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms