Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
P20040 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
P20040 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
P20040 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
P20040 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
P20040 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
P20040 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
P20040 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
P20040 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P20040 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P20040 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P20040 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P20040 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P20040 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P20040 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P20040 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P20040 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P20040 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P20040 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P20040 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P20040 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P20040 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P20040 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
P20040 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P20040 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P20040 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
P20040 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P20040 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
P20040 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P20040 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P20040 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P20040 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
P20040 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P20040 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P20040 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P20040 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
P20040 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P20040 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P20040 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P20040 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
P20040 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
P20040 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
P20040 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
P20040 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
P20040 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P20040 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P20040 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P20040 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P20040 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
P20040 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P20040 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P20040 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P20040 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P20040 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
P20040 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P20040 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P20040 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
P20040 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P20040 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P20040 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
P20040 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P20040 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P20040 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P20040 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P20040 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P20040 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
P20040 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P20040 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P20040 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
P20040 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
P20040 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P20040 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P20040 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P20040 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P20040 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
P20040 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
P20040 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
P20040 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
P20040 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P20040 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
P20040 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P20040 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P20040 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P20040 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P20040 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P20040 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
P20040 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P20040 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P20040 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P20040 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P20040 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P20040 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
P20040 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
P20040 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
P20040 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
P20040 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
P20040 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
P20040 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
P20040 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
P20040 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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