Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rps6ka3P18654 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rps6ka3P18654 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms