Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcnaP17918 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcnaP17918 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PcnaP17918 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcnaP17918 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcnaP17918 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcnaP17918 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PcnaP17918 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PcnaP17918 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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