Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cd44P15379 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd44P15379 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd44P15379 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd44P15379 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd44P15379 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd44P15379 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd44P15379 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd44P15379 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd44P15379 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Cd44P15379 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms