Protein–RNA interactions for Protein: P13516

Scd1, Acyl-CoA desaturase 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd1P13516 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd1P13516 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd1P13516 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scd1P13516 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scd1P13516 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms