Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtcP11725 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtcP11725 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtcP11725 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtcP11725 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtcP11725 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtcP11725 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtcP11725 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtcP11725 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtcP11725 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtcP11725 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtcP11725 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtcP11725 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtcP11725 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtcP11725 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtcP11725 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtcP11725 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtcP11725 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtcP11725 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtcP11725 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtcP11725 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtcP11725 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtcP11725 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtcP11725 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtcP11725 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtcP11725 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
OtcP11725 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
OtcP11725 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
OtcP11725 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
OtcP11725 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
OtcP11725 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
OtcP11725 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
OtcP11725 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
OtcP11725 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
OtcP11725 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
OtcP11725 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
OtcP11725 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
OtcP11725 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
OtcP11725 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
OtcP11725 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
OtcP11725 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
OtcP11725 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
OtcP11725 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
OtcP11725 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
OtcP11725 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
OtcP11725 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
OtcP11725 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
OtcP11725 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
OtcP11725 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
OtcP11725 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
OtcP11725 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
OtcP11725 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
OtcP11725 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
OtcP11725 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
OtcP11725 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtcP11725 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtcP11725 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtcP11725 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtcP11725 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtcP11725 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtcP11725 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtcP11725 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtcP11725 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtcP11725 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtcP11725 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtcP11725 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtcP11725 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtcP11725 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtcP11725 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
OtcP11725 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
OtcP11725 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtcP11725 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtcP11725 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtcP11725 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtcP11725 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtcP11725 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtcP11725 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtcP11725 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtcP11725 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtcP11725 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtcP11725 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtcP11725 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtcP11725 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
OtcP11725 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtcP11725 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtcP11725 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtcP11725 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
OtcP11725 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtcP11725 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtcP11725 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtcP11725 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtcP11725 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtcP11725 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtcP11725 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtcP11725 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtcP11725 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtcP11725 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtcP11725 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
OtcP11725 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
OtcP11725 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms