Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P10404 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P10404 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P10404 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P10404 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P10404 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P10404 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P10404 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P10404 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P10404 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P10404 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P10404 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P10404 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P10404 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P10404 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P10404 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P10404 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P10404 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P10404 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P10404 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P10404 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P10404 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P10404 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P10404 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P10404 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P10404 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P10404 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P10404 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P10404 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P10404 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P10404 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P10404 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P10404 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P10404 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P10404 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P10404 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P10404 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P10404 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P10404 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P10404 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P10404 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P10404 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P10404 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P10404 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P10404 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P10404 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P10404 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P10404 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P10404 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P10404 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P10404 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P10404 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P10404 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P10404 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P10404 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P10404 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P10404 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P10404 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P10404 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P10404 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P10404 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P10404 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P10404 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P10404 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P10404 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P10404 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P10404 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P10404 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P10404 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P10404 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P10404 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P10404 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P10404 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P10404 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P10404 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P10404 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P10404 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P10404 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P10404 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P10404 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P10404 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P10404 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P10404 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P10404 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P10404 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P10404 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P10404 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P10404 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P10404 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P10404 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P10404 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P10404 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P10404 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P10404 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P10404 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P10404 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P10404 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P10404 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P10404 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P10404 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms