Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
TtrP07309 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtrP07309 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtrP07309 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtrP07309 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtrP07309 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtrP07309 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtrP07309 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtrP07309 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtrP07309 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtrP07309 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtrP07309 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtrP07309 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtrP07309 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtrP07309 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtrP07309 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
TtrP07309 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtrP07309 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtrP07309 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtrP07309 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtrP07309 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtrP07309 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtrP07309 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtrP07309 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtrP07309 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtrP07309 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtrP07309 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtrP07309 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtrP07309 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtrP07309 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtrP07309 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtrP07309 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtrP07309 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtrP07309 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtrP07309 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtrP07309 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TtrP07309 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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TtrP07309 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TtrP07309 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TtrP07309 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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TtrP07309 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TtrP07309 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TtrP07309 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TtrP07309 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TtrP07309 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TtrP07309 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
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TtrP07309 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TtrP07309 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TtrP07309 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TtrP07309 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtrP07309 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtrP07309 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtrP07309 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtrP07309 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtrP07309 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtrP07309 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtrP07309 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtrP07309 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtrP07309 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtrP07309 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtrP07309 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtrP07309 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtrP07309 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtrP07309 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtrP07309 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TtrP07309 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtrP07309 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
TtrP07309 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtrP07309 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TtrP07309 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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