Protein–RNA interactions for Protein: P06336

Ig epsilon chain C region, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06336 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06336 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06336 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06336 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06336 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06336 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06336 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06336 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06336 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P06336 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06336 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06336 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06336 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06336 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06336 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06336 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06336 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06336 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06336 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06336 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06336 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06336 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06336 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06336 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06336 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06336 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06336 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06336 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06336 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06336 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06336 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06336 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06336 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
P06336 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
P06336 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06336 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06336 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06336 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06336 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06336 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06336 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06336 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06336 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06336 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06336 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06336 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06336 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06336 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06336 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06336 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06336 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06336 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06336 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06336 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06336 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06336 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06336 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06336 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06336 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06336 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06336 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06336 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06336 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06336 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
P06336 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06336 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06336 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06336 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06336 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06336 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06336 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06336 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06336 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06336 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06336 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06336 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06336 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06336 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06336 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06336 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06336 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06336 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06336 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06336 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06336 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06336 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06336 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06336 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06336 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06336 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
P06336 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06336 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06336 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06336 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06336 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06336 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06336 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06336 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06336 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P06336 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms