Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01667 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01667 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01667 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01667 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01667 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01667 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01667 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01667 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P01667 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01667 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01667 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01667 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01667 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01667 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01667 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01667 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01667 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01667 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01667 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01667 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01667 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01667 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01667 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01667 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01667 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01667 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01667 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01667 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01667 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01667 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01667 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01667 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01667 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01667 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01667 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P01667 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01667 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01667 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01667 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01667 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01667 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01667 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01667 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01667 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01667 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P01667 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01667 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01667 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01667 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01667 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01667 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01667 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01667 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01667 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01667 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01667 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
P01667 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01667 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01667 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01667 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01667 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01667 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01667 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01667 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01667 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01667 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P01667 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01667 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01667 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01667 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01667 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01667 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01667 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01667 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01667 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01667 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01667 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01667 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01667 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01667 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01667 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01667 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01667 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01667 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01667 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01667 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01667 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01667 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01667 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P01667 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01667 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01667 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01667 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01667 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01667 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01667 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01667 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01667 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P01667 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms