Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp1O89090 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp1O89090 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp1O89090 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp1O89090 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp1O89090 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sp1O89090 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp1O89090 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sp1O89090 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms