Protein–RNA interactions for Protein: O88834

Shd, SH2 domain-containing adapter protein D, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShdO88834 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ShdO88834 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ShdO88834 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ShdO88834 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ShdO88834 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ShdO88834 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ShdO88834 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ShdO88834 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ShdO88834 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ShdO88834 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ShdO88834 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ShdO88834 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ShdO88834 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ShdO88834 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ShdO88834 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ShdO88834 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ShdO88834 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ShdO88834 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ShdO88834 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ShdO88834 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ShdO88834 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ShdO88834 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ShdO88834 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ShdO88834 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ShdO88834 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ShdO88834 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ShdO88834 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ShdO88834 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ShdO88834 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ShdO88834 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ShdO88834 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ShdO88834 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ShdO88834 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ShdO88834 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ShdO88834 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ShdO88834 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ShdO88834 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ShdO88834 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ShdO88834 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ShdO88834 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ShdO88834 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ShdO88834 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ShdO88834 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ShdO88834 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ShdO88834 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ShdO88834 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ShdO88834 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ShdO88834 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ShdO88834 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ShdO88834 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ShdO88834 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ShdO88834 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ShdO88834 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ShdO88834 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ShdO88834 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ShdO88834 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ShdO88834 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ShdO88834 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ShdO88834 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ShdO88834 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ShdO88834 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ShdO88834 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ShdO88834 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ShdO88834 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ShdO88834 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ShdO88834 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ShdO88834 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ShdO88834 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ShdO88834 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ShdO88834 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ShdO88834 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ShdO88834 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ShdO88834 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ShdO88834 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ShdO88834 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ShdO88834 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ShdO88834 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ShdO88834 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ShdO88834 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ShdO88834 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ShdO88834 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ShdO88834 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ShdO88834 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ShdO88834 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ShdO88834 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ShdO88834 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ShdO88834 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ShdO88834 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ShdO88834 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ShdO88834 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ShdO88834 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ShdO88834 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ShdO88834 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ShdO88834 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ShdO88834 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ShdO88834 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ShdO88834 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ShdO88834 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ShdO88834 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ShdO88834 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms