Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns1O88456 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns1O88456 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns1O88456 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capns1O88456 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capns1O88456 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capns1O88456 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Capns1O88456 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Capns1O88456 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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