Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Itgb5O70309 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms