Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3aO70157 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3aO70157 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3aO70157 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Top3aO70157 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top3aO70157 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Top3aO70157 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3aO70157 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top3aO70157 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Top3aO70157 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms