Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChkbO55229 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChkbO55229 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChkbO55229 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChkbO55229 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChkbO55229 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChkbO55229 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChkbO55229 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ChkbO55229 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ChkbO55229 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ChkbO55229 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ChkbO55229 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ChkbO55229 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChkbO55229 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChkbO55229 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ChkbO55229 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms