Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlx3O55144 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tlx3O55144 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tlx3O55144 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms