Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif6O55135 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif6O55135 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif6O55135 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif6O55135 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif6O55135 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Eif6O55135 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif6O55135 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif6O55135 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif6O55135 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif6O55135 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif6O55135 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif6O55135 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif6O55135 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif6O55135 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif6O55135 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif6O55135 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif6O55135 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif6O55135 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif6O55135 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif6O55135 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif6O55135 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif6O55135 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif6O55135 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Eif6O55135 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif6O55135 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif6O55135 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif6O55135 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif6O55135 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif6O55135 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif6O55135 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif6O55135 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Eif6O55135 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms