Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Opn1mwO35599 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Opn1mwO35599 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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