Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk4O35493 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk4O35493 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clk4O35493 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk4O35493 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk4O35493 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk4O35493 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk4O35493 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk4O35493 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clk4O35493 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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