Protein–RNA interactions for Protein: O35492

Clk3, Dual specificity protein kinase CLK3, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk3O35492 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk3O35492 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk3O35492 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Clk3O35492 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk3O35492 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk3O35492 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk3O35492 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk3O35492 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk3O35492 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk3O35492 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms