Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnxbO35452 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TnxbO35452 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TnxbO35452 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TnxbO35452 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TnxbO35452 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TnxbO35452 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TnxbO35452 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TnxbO35452 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TnxbO35452 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TnxbO35452 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TnxbO35452 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms