Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Scarb2O35114 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Scarb2O35114 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Scarb2O35114 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Scarb2O35114 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Scarb2O35114 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Scarb2O35114 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Scarb2O35114 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Scarb2O35114 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Scarb2O35114 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Scarb2O35114 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Scarb2O35114 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Scarb2O35114 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Scarb2O35114 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Scarb2O35114 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Scarb2O35114 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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