Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Kif3cO35066 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif3cO35066 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif3cO35066 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif3cO35066 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif3cO35066 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif3cO35066 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif3cO35066 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif3cO35066 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif3cO35066 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif3cO35066 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif3cO35066 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif3cO35066 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif3cO35066 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif3cO35066 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif3cO35066 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif3cO35066 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif3cO35066 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif3cO35066 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif3cO35066 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kif3cO35066 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms