Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn4O35054 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn4O35054 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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