Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hps1O08983 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hps1O08983 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Hps1O08983 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps1O08983 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps1O08983 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hps1O08983 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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