Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vmn2r88L7N1W8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn2r88L7N1W8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn2r88L7N1W8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn2r88L7N1W8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn2r88L7N1W8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn2r88L7N1W8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn2r88L7N1W8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vmn2r88L7N1W8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r88L7N1W8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r88L7N1W8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r88L7N1W8 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r88L7N1W8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r88L7N1W8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r88L7N1W8 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r88L7N1W8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r88L7N1W8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r88L7N1W8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r88L7N1W8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn2r88L7N1W8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms