Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Homer1-208ENSMUST00000109495 813 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gm14833-201ENSMUST00000118345 1027 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Vmn1r-ps62-201ENSMUST00000173275 910 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 1700122D07Rik-201ENSMUST00000186973 421 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gm20121-201ENSMUST00000198547 1594 ntBASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC8.01□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 AC131120.1-201ENSMUST00000217728 1617 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gm11656-201ENSMUST00000137462 395 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gm23776-201ENSMUST00000158993 325 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gm3486-201ENSMUST00000169361 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gm37223-206ENSMUST00000195070 699 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gm44738-201ENSMUST00000206393 371 ntTSL 2 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 AC167202.1-201ENSMUST00000219027 331 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Mkl2-202ENSMUST00000056715 618 ntTSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Olfr266-201ENSMUST00000059486 1027 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Gm45635-201ENSMUST00000211516 2134 ntBASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8□□□□□ -1.13
Gm21887J3QQ04 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms