Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm3415J3QMS8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3415J3QMS8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3415J3QMS8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3415J3QMS8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3415J3QMS8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3415J3QMS8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3415J3QMS8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3415J3QMS8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3415J3QMS8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3415J3QMS8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3415J3QMS8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3415J3QMS8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3415J3QMS8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm3415J3QMS8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm3415J3QMS8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms