Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Gm21060J3KMU4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
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