Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcf11G3X9Z4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms