Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Slc9a3G3X939 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc9a3G3X939 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc9a3G3X939 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc9a3G3X939 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc9a3G3X939 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc9a3G3X939 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slc9a3G3X939 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms