Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Vmn1r76F8VQ63 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Vmn1r76F8VQ63 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms